Đại tá, GS.TSKH TTND
Đặng Đình Huấn
Phó Hiệu trưởng (1951 - 1981)
Đại tá, GS.TS AHLĐ
Nguyễn Thiện Thành
Phó Viện trưởng (1960 - 1964)
Trung tướng, GS. TS
Nguyễn Thế Khánh
Phó Viện trưởng (1962 - 1966)
Đại tá, GS.TS
Vũ Tá Cúc
Phó Hiệu trưởng (1962-1979)
Đại tá, PGS
Nguyễn Tăng Ấn
Phó Hiệu trưởng (1964-1976)
Đại tá
Võ Văn Dật
Phó Hiệu trưởng Trường Đại học Quân y (8/1966-8/1979)
Đại tá, PGS
Bùi Thế Sinh
Phó Giám đốc Học viện Quân y (12/1981 -7/1987)
Đại tá,
Lê Công
Phó Hiệu trưởng Trường Đại học Quân y (6/1978-5/1981)
Thiếu tướng GS.TSKH
Bùi Đại
Phó Viện trưởng (1978 - 1983)
Đại tá
Bùi Quốc Miện
Phó hiệu trưởng (4/1981 - 8/2981)
Đại tá
Hoàng Tường
Phó giám đốc (5/1982 - 7/1988)
Đại tá
Hà Hữu Thừa
Phó Giám đốc (7/1982 - 1/1992)
Thiếu tướng, GS.TSKH
Nguyễn Hưng Phúc
Phó Giám đốc (1982 - 1995)
Đại tá, GS. TSKH
Nguyễn Xuân Phachs
Phó Giám đốc (12/1983 - 1997)
Đại tá
Nguyễn Văn Toàn
Phó Giám đốc (11/1995 - 4/2001)
Đại tá, GS. TS
Nguyễn Văn Nguyên
Phó Giám đốc (2/1995 - 9/2005)
Thiếu tướng, GS. TS
Vũ Đức Mối
Phó Giám đốc (2000 - 2007)
Thiếu tướng, GS. TS
Lê Bách Quang
Phó Giám đốc (2001 - 2007)
Thiếu tướng
Hoàng Văn Hoặc
Phó Giám đốc (8/2002 - 2012)
Thiếu tướng PGS.TS
Đặng Ngọc Hùng
Phó Giám đốc (2005 - 2007)
Thiếu tướng GS.TS
Đồng Khắc Hưng
Phó Giám đốc (12/2007 – 2/2017)
Thiếu tướng PGS.TS
Vũ Huy Nùng
Phó giám đốc (11/2008 – 8/2013)
Thiếu tướng
Phạm Văn Mạnh
Phó Giám đốc (10/2011-2/2017)
Thiếu tướng, GS.TS
Nguyễn Trường Giang
Phó Giám đốc (2/2017 - 5/2022)
